Schäle die Zwiebel und Knoblauchzehe und hacke beides fein.
Entferne das Kraut und die Wurzelansätze vom Fenchel und wasche ihn. Entferne dann die Stiele und halbiere die Knolle einmal. Lege das Fenchelgrün für später beiseite.
Schäle die Kartoffeln und schneide sie der Länge nach in dünne Scheiben oder hobel sie.
Erhitze die Butter in einem Topf. Gib die gehackte Zwiebel und den Knoblauch dazu und brate beides bei mittlerer Hitze in 2–4 Minuten an. Bestäube sie anschließend mit dem Mehl und lass es unter Rühren anschwitzen. Rühre dann langsam Milch ein.
Lass alles unter Rühren 3–5 Minuten köcheln, bis die Béchamelsoße eingedickt ist. Hacke die Kapern fein. Spüle die Zitrone heiß ab, tupfe sie trocken und reibe einen halben TL von der Schale fein ab. Schmecke die Béchamelsoße mit Kapern, Zitronenschale, Salz und Pfeffer ab.
Schichte die Kartoffelscheiben und Fenchel in einer Auflaufform, gieße die Béchamelsoße darüber und streue geriebenen Parmesan darüber. Backe den Fenchel-Auflauf bei 180 °C Ober-/Unterhitze für etwa 45 Minuten.
Bestreue den Auflauf vor dem Servieren mit dem Fenchelgrün, wenn du magst.
